阴道是女性生殖系统的重要组成部分，其内部组织有着独特的结构特点。从整体来看，阴道是一个上宽下窄的肌性管道，前壁长约7 - 9厘米，后壁长约10 - 12厘米。阴道壁由黏膜、肌层和外膜组成。黏膜层是阴道的最内层，它具有丰富的皱襞，这些皱襞在阴道扩张时可以伸展，在阴道收缩时又能恢复原状，有助于阴道在分娩、性行为等过程中适应不同的状态。黏膜层还含有大量的糖原，在阴道内乳酸杆菌的作用下分解为乳酸，使阴道保持酸性环境，这种酸性环境对于抑制有害细菌的生长、维护阴道的健康起着至关重要的作用。
阴道黏膜层由复层鳞状上皮覆盖，无腺体。上皮细胞会随着月经周期发生变化，在雌激素的影响下，上皮细胞会增生、变厚。在青春期前，阴道黏膜薄，皱襞少；青春期后，随着雌激素水平的升高，黏膜增厚，皱襞增多。黏膜表面有许多微小的突起，称为微绒毛，它们增加了黏膜的表面积，有利于物质的交换和吸收。同时，黏膜层还含有丰富的神经末梢，这使得阴道在性行为等过程中能够产生敏感的感觉。而且，黏膜层的血液供应也十分丰富，为其正常的生理功能提供了充足的营养支持。
阴道肌层由两层平滑肌组成，内层为环形肌，外层为纵行肌。这两层肌肉相互配合，使得阴道具有良好的收缩和扩张能力。环形肌的收缩可以使阴道管径变小，增强对阴茎等物体的包裹感；纵行肌的收缩则有助于阴道在分娩时的伸展和扩张，使胎儿能够顺利通过。此外，肌层的收缩还可以促进阴道内的血液循环，维持阴道组织的正常代谢。在性兴奋时，肌层会发生节律性的收缩，这种收缩不仅可以增强性快感，还能促进精液向子宫方向的移动，提高受孕的几率。
阴道外膜为疏松结缔组织，它与周围的组织相连，起到固定阴道位置的作用。外膜中含有丰富的血管、淋巴管和神经，这些结构为阴道提供了必要的营养和神经支配。血管负责为阴道组织输送氧气和营养物质，同时带走代谢废物；淋巴管则参与免疫防御，能够过滤和清除阴道内的病原体。神经可以将阴道的感觉信息传递到中枢神经系统，使人体感知到阴道内的各种刺激。外膜的存在还使得阴道与周围的器官如膀胱、尿道、直肠等相互协调，共同完成各自的生理功能。
阴道穹窿是阴道上端环绕子宫颈的部分，分为前、后、左、右四部分。其中，后穹窿最深，与盆腔最低的直肠子宫陷凹紧密相邻。在临床上，后穹窿具有重要的意义。当盆腔内有积液、积血或脓肿等情况时，液体常常会积聚在直肠子宫陷凹内，此时可以通过后穹窿穿刺抽取液体进行检查，以明确诊断。此外，在某些手术中，也可以通过后穹窿进入盆腔，进行相应的操作。前穹窿相对较浅，与膀胱相邻；左右穹窿则位于子宫颈的两侧。阴道穹窿的存在增加了阴道的容积，也为性行为等提供了一定的空间。