在同房之后出现肚子疼的情况，可能是生理性原因导致的。性生活时，由于性兴奋，生殖器官会处于高度充血状态，盆腔组织会发生不同程度的应激反应。如果性生活过于剧烈，时间过长，就容易引起女性盆腔淤血，进而导致肚子疼。这种疼痛通常较为轻微，休息一段时间后可自行缓解。而且，在性高潮时，子宫会出现收缩现象，对于一些较为敏感的人来说，也可能会感觉到腹部的隐痛或坠胀感。
妇科炎症是导致同房后肚子疼的常见病理性原因之一。例如盆腔炎，盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症，在性生活的刺激下，炎症部位受到触动和摩擦，会引起疼痛加剧。患者平时可能就有下腹部坠胀、疼痛及腰骶部酸痛的症状，在劳累、性交后及月经前后会加重。还有宫颈炎，宫颈是性生活中直接接触的部位，患有宫颈炎时，宫颈表面充血、水肿，性生活时的刺激会导致疼痛，疼痛可能表现为下腹部或腰骶部的坠痛，有时还会伴有性交出血等症状。
子宫内膜异位症也是造成同房后肚子疼的重要因素。正常情况下，子宫内膜应该生长在子宫腔内，但当内膜细胞出现在子宫体以外的部位时，就形成了子宫内膜异位症。这些异位的内膜组织在性生活过程中受到刺激，会引起疼痛。疼痛的程度和部位因人而异，有的患者可能表现为深部性交痛，尤其是在月经来潮前性交疼痛会更加明显。而且，随着病情的发展，疼痛可能会逐渐加重，还可能影响到患者的生育功能。
黄体破裂是一种较为紧急的情况。在女性排卵后，卵巢会形成黄体，正常情况下黄体会自行萎缩。但如果在性生活时，女性的腹部受到强烈的外力撞击，或者性生活过于剧烈，就可能导致黄体破裂。患者会突然感觉到一侧下腹部剧烈疼痛，疼痛程度较为严重，还可能伴有恶心、呕吐等症状。如果出血较多，还会出现头晕、乏力等休克症状，需要及时就医进行治疗。
肠道问题也可能是同房后肚子疼的原因。性生活时，由于身体的运动和姿势的改变，可能会对肠道产生一定的挤压和刺激。如果本身肠道功能就不太好，或者存在肠道痉挛、肠炎等问题，就容易引发肚子疼。患者可能会伴有腹胀、腹泻、便秘等症状。此外，性生活时着凉，也可能导致肠道蠕动加快，引起肠痉挛，从而出现肚子疼的情况。对于这种情况，一般可以通过调整饮食、注意腹部保暖等方法来缓解。