睡眠姿势不当是导致睡觉醒来后背疼的常见原因之一。很多人在睡觉时习惯保持不良姿势，比如长时间蜷缩身体、过度扭转等。蜷缩身体会使背部肌肉长时间处于紧张状态，得不到充分的放松，脊柱的正常生理曲度也会受到影响，久而久之就容易引发疼痛。过度扭转则会对背部的关节和肌肉造成额外的压力，导致局部血液循环不畅，代谢废物堆积，刺激神经末梢，进而产生疼痛感。而且，不良的睡眠姿势还可能导致脊柱关节错位或半脱位，进一步加重背部疼痛的症状。
床垫的软硬度对睡眠质量和背部健康有着重要影响。如果床垫过软，身体会陷进床垫中，脊柱无法保持正常的生理曲度，背部肌肉需要持续用力来维持身体的姿势，容易造成肌肉疲劳和劳损，从而引起后背疼痛。相反，床垫过硬，会使身体与床垫的接触面积减小，压力集中在某些部位，如肩部、臀部和背部，导致这些部位承受过大的压力，血液循环受阻，也会引发后背疼痛。此外，床垫使用时间过长，弹性下降，也会影响其对身体的支撑效果，增加后背疼痛的发生几率。
在睡眠过程中，如果背部没有做好保暖措施，受到寒冷刺激，会导致背部血管收缩，血液循环减慢。这会使背部肌肉和组织得不到足够的营养和氧气供应，代谢产物也无法及时排出，从而引起肌肉痉挛和疼痛。尤其是在夏季，很多人喜欢开着空调睡觉，而且不注意背部的保暖，更容易出现这种情况。另外，冬季睡觉时被子没有盖好，背部暴露在寒冷的空气中，也会导致后背受凉疼痛。
一些疾病也可能导致睡觉醒来后背疼。例如，颈椎病患者，由于颈椎病变可能会压迫神经，引起背部放射性疼痛。腰椎间盘突出症患者，突出的椎间盘可能会压迫周围的神经和组织，导致腰部和背部疼痛。此外，强直性脊柱炎、类风湿关节炎等风湿免疫性疾病，也会累及背部关节和肌肉，导致后背疼痛，且这种疼痛通常在早晨起床时较为明显，活动后可能会有所缓解。另外，胆囊炎、胆结石等疾病，有时也会引起背部放射性疼痛。
长期的精神压力会导致身体处于紧张状态，肌肉也会随之紧绷。在睡眠中，即使身体处于休息状态，背部肌肉可能仍然无法完全放松，容易造成肌肉疲劳和疼痛。而且，精神压力还可能影响睡眠质量，导致睡眠不足或睡眠质量差，进一步加重后背疼痛的症状。此外，压力过大还可能引发焦虑、抑郁等情绪问题，这些情绪问题又会反过来影响身体的疼痛感受，形成恶性循环。