在治疗血栓的过程中，抗血小板药物是常用的一类。阿司匹林是经典的抗血小板药物，它通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板的聚集。常用于预防动脉血栓的形成，像冠心病、脑梗死等疾病的二级预防。氯吡格雷则是一种新型的抗血小板药物，它作用于血小板的P2Y12受体，抑制ADP介导的血小板活化和聚集。对于阿司匹林不耐受或者高危的急性冠状动脉综合征患者，氯吡格雷是不错的选择。这些药物能降低血小板的活性，减少血栓形成的风险，但使用时需要注意可能出现的出血等不良反应。
抗凝药物在血栓治疗中也占据重要地位。肝素是一种常用的抗凝剂，它可以增强抗凝血酶Ⅲ的活性，加速凝血因子的灭活，从而起到抗凝作用。普通肝素起效快，作用时间短，常用于急性血栓形成的治疗，比如急性肺栓塞、深静脉血栓形成的初期治疗。低分子肝素是普通肝素经过化学裂解等方法制成，它的抗凝作用更稳定，出血风险相对较低，使用也更方便，不需要频繁监测凝血指标。华法林是一种口服抗凝药物，它通过抑制维生素K依赖的凝血因子的合成来发挥抗凝作用。但华法林的治疗窗较窄，需要定期监测国际标准化比值（INR），以调整药物剂量，确保抗凝效果的同时减少出血风险。
溶栓药物主要用于急性血栓的溶解。尿激酶是一种直接作用于纤溶酶原的溶栓药物，它可以将纤溶酶原激活为纤溶酶，从而溶解已经形成的血栓。尿激酶价格相对较低，在临床上应用较为广泛，常用于急性心肌梗死、脑梗死等疾病的早期溶栓治疗。重组组织型纤溶酶原激活剂（rt - PA）是一种新型的溶栓药物，它对纤维蛋白具有较高的亲和力，能够特异性地激活血栓表面的纤溶酶原，使血栓溶解。rt - PA的溶栓效果较好，但价格相对较高，且有一定的出血风险。
中药及中成药在血栓治疗中也有一定的作用。丹参具有活血化瘀的功效，它可以改善血液循环，抑制血小板聚集，降低血液黏稠度。丹参注射液、丹参片等在临床上常用于冠心病、脑供血不足等疾病的辅助治疗。三七也是一种常用的活血化瘀中药，它含有多种活性成分，如三七皂苷等，具有抗血栓、改善微循环等作用。一些中成药如血塞通胶囊、通心络胶囊等，以三七等中药为主要成分，在治疗血栓相关疾病方面有一定的疗效，且副作用相对较小。
随着医学的发展，一些新型的抗血栓药物不断涌现。达比加群酯是一种新型的口服抗凝药物，它直接抑制凝血酶的活性，不需要监测凝血指标，使用方便。利伐沙班是一种新型的Xa因子抑制剂，它可以选择性地抑制Xa因子的活性，从而阻断凝血瀑布的级联反应，达到抗凝作用。这些新型药物的出血风险相对较低，为血栓患者提供了更多的治疗选择。但新型药物价格相对较高，且在使用过程中也需要注意观察不良反应。