在医学检查领域，MR和CT都是常用的影像检查手段，它们在成像原理上有着本质区别。CT即电子计算机断层扫描，它是利用精确准直的X线束、γ射线、超声波等，与灵敏度极高的探测器一同围绕人体的某一部位作一个接一个的断面扫描。其原理主要是根据人体不同组织对X线吸收与透过率的不同，应用灵敏度极高的仪器对人体进行测量，然后将测量所获取的数据输入电子计算机，电子计算机对数据进行处理后，就可摄下人体被检查部位的断面或立体的图像，发现体内任何部位的细小病变。
而MR也就是磁共振成像，它的成像原理和CT完全不同。MR是利用原子核自旋运动的特点，在外加磁场内，经射频脉冲激后产生信号，用探测器检测并输入计算机，经过处理转换在屏幕上显示图像。简单来说，它是通过对静磁场中的人体施加某种特定频率的射频脉冲，使人体中的氢质子受到激励而发生磁共振现象。当终止射频脉冲后，氢质子在弛豫过程中产生磁共振信号，通过对磁共振信号的接收、空间编码和图像重建等处理过程，最终形成磁共振图像。这种成像方式能够提供多参数、多方位的图像信息，对于软组织的分辨能力要比CT强很多。
CT检查具有扫描速度快的优势，对于一些急诊患者，如头部外伤、急性脑出血等情况，能够快速获得清晰的图像，帮助医生及时做出诊断。而且CT对骨骼、肺部等部位的病变显示较为清晰，在判断骨折的类型、肺部炎症、肿瘤等方面具有重要价值。它的图像可以清晰地显示骨骼的形态、结构以及肺部的细微纹理，对于一些早期病变的发现也有一定的帮助。
MR检查则在神经系统、软组织和关节等方面具有独特的优势。在神经系统方面，它能够清晰地显示脑和脊髓的细微结构，对于脑肿瘤、脑梗死、脊髓损伤等疾病的诊断准确性较高。在软组织方面，如肌肉、肌腱、韧带等，MR可以清晰地显示其形态、结构和病变情况，对于早期发现软组织损伤、肿瘤等病变具有重要意义。在关节检查中，MR能够清晰地显示关节软骨、半月板、韧带等结构，对于诊断关节疾病，如半月板损伤、韧带撕裂等具有很高的价值。
CT检查也存在一定的局限性。由于它是利用X线进行扫描，所以存在一定的辐射剂量，虽然单次检查的辐射剂量在安全范围内，但对于一些需要多次检查的患者，可能会有一定的潜在风险。而且CT对于软组织的分辨能力相对较弱，对于一些软组织病变的早期诊断可能存在一定的困难。此外，CT检查对于体内有金属植入物的患者不适用，因为金属会产生伪影，影响图像质量。
MR检查同样有其局限性。首先，它的检查时间相对较长，一般需要十几分钟到几十分钟不等，对于一些不能配合的患者，如儿童、意识不清者等，可能需要使用镇静剂才能完成检查。其次，MR检查费用相对较高，这在一定程度上限制了其广泛应用。另外，体内有心脏起搏器、金属假牙、人工关节等金属物品的患者不能进行MR检查，因为强大的磁场可能会使金属物品移位，对患者造成伤害。
CT检查适用于多种疾病的初步筛查和诊断。在头部，可用于诊断脑出血、脑梗死、脑肿瘤、头部外伤等；在胸部，可用于检查肺部炎症、肿瘤、气胸等；在腹部，可用于观察肝脏、胆囊、胰腺、脾脏等器官的病变，如肝囊肿、肝癌、胆囊炎等；在骨骼系统，可用于诊断骨折、骨肿瘤等。它能够快速、准确地发现病变的位置、大小和形态，为进一步的治疗提供重要依据。
MR检查则更适用于对软组织病变的深入诊断。在神经系统，常用于脑和脊髓疾病的诊断，如脑肿瘤的定性诊断、脊髓空洞症的诊断等；在肌肉骨骼系统，可用于诊断肌肉损伤、骨髓炎、骨肿瘤等；在腹部和盆腔，可用于观察肝脏、胰腺、肾脏等器官的病变，以及子宫、卵巢等生殖器官的疾病。它能够提供更加详细的病变信息，对于疾病的早期诊断和治疗方案的制定具有重要意义。
在进行CT检查前，患者需要去除检查部位的金属物品，如项链、耳环、手表等，以避免产生伪影影响图像质量。如果是进行腹部CT检查，患者需要在检查前禁食4-6小时，以减少胃肠道内气体的干扰。同时，患者需要向医生说明自己的病史、过敏史等情况，特别是是否对碘造影剂过敏，因为在一些CT检查中可能需要使用造影剂来增强图像的对比度。
进行MR检查前，患者需要去除身上所有的金属物品，包括假牙、发卡、胸罩等。体内有金属植入物的患者需要提前告知医生，由医生判断是否适合进行MR检查。由于MR检查时间较长，患者需要在检查过程中保持安静，避免随意移动身体，以免影响图像质量。同时，患者可能会听到机器发出的较大噪音，医生会为患者提供耳塞或耳机以减轻噪音的影响。