苦瓜属于寒凉性食物，鸡蛋富含蛋白质。对于肠胃功能较弱的人群而言，食用苦瓜炒鸡蛋可能会引发肠胃不适。苦瓜中的一些成分可能会刺激肠胃黏膜，而鸡蛋中的蛋白质在消化过程中需要较多的胃酸和消化酶。当两者结合食用时，肠胃负担会加重。尤其是空腹食用苦瓜炒鸡蛋，更容易导致消化不良、腹痛、腹泻等症状。因为空腹时肠胃较为敏感，对食物的耐受性降低，寒凉的苦瓜和相对难消化的鸡蛋一起进入肠胃，会使肠胃受到较大刺激，影响正常的消化功能。
部分人群可能对苦瓜或鸡蛋过敏。对苦瓜过敏的人，食用苦瓜炒鸡蛋后，可能会出现皮肤瘙痒、红肿、皮疹等症状，严重的还可能出现呼吸道症状，如呼吸急促、喘息等。而对鸡蛋过敏的情况更为常见，鸡蛋中的蛋白质是常见的过敏原，过敏者食用后可能会引发口腔肿胀、恶心、呕吐、腹痛等症状。一旦出现过敏反应，应立即停止食用，并根据过敏的严重程度采取相应的措施，如症状较轻可自行观察，症状严重则需及时就医。
虽然苦瓜有一定的降血糖作用，但苦瓜炒鸡蛋中的鸡蛋含有一定量的脂肪和蛋白质。这些物质在体内代谢时会影响血糖的变化。对于糖尿病患者来说，如果在食用苦瓜炒鸡蛋时不注意控制量，或者与其他食物搭配不合理，可能会导致血糖出现波动。此外，烹饪苦瓜炒鸡蛋时如果加入过多的油和糖等调料，也会使这道菜的热量升高，不利于血糖的稳定控制。所以糖尿病患者在食用苦瓜炒鸡蛋时，要严格控制食用量，并密切关注血糖的变化。
鸡蛋含有丰富的蛋白质，人体摄入过多的蛋白质后，会产生较多的含氮废物，需要通过肾脏排出体外。苦瓜中也含有一些矿物质和成分，当两者一起大量食用时，会增加肾脏的代谢负担。对于肾功能不全的人群来说，肾脏的排泄和代谢功能已经减弱，过多食用苦瓜炒鸡蛋可能会导致体内废物堆积，进一步损害肾脏功能。因此，肾功能不好的人应该适量食用苦瓜炒鸡蛋，避免给肾脏造成过大的压力。
如果长期将苦瓜炒鸡蛋作为主要菜肴，可能会导致营养不均衡。虽然苦瓜和鸡蛋都含有一定的营养成分，但它们不能提供人体所需的全部营养素。苦瓜炒鸡蛋中维生素和矿物质的种类相对有限，缺乏膳食纤维、碳水化合物等其他重要营养素。长期单一食用这道菜，会使人体无法获得全面的营养，影响身体健康。为了保证营养均衡，应该多样化饮食，搭配其他蔬菜、水果、谷物等食物一起食用。