在中医理论里，六腑指的是胆、胃、小肠、大肠、膀胱、三焦。而被称为“孤腑”的是三焦。三焦这一概念较为独特，它不像其他五腑有明显可见的实体形态。三焦的“孤”，一方面体现在其位置上，它是分布于胸腹腔的一个大腑，不像其他五腑那样有明确对应的单一器官形态。另一方面，它在功能上也具有综合性和独特性，与其他五腑既有联系又有区别，所以被赋予了“孤腑”这一特殊称谓。
三焦在部位上可分为上焦、中焦和下焦。上焦一般指横膈以上的胸部，包括心、肺等脏腑。上焦的主要功能是主气的升发和宣散，就像自然界的雾露一样，将水谷精气布散到全身。中焦是指横膈以下至脐的部位，包含脾胃等脏腑。中焦的功能如同沤，主要是腐熟水谷，将食物消化吸收，转化为气血津液。下焦则是指脐以下的部位，涵盖了小肠、大肠、肾、膀胱等脏腑。下焦的作用如同渎，主要是排泄糟粕和尿液，有向下疏通、向外排泄的特点。
三焦具有通行元气的功能。元气是人体最根本的气，它根源于肾，通过三焦而布散到全身，激发和推动各个脏腑组织的功能活动。同时，三焦还是水液运行的通道。人体的津液代谢，是通过肺、脾、肾等脏腑的协同作用来完成的，但必须以三焦为通道，才能正常地升降出入。此外，三焦还参与了人体的气化过程，促进了物质的转化和能量的代谢，维持着人体生理功能的正常运行。
三焦与其他脏腑有着密切的关系。它与心、肺在上焦相互协作，共同完成气血的运行和布散。与脾胃在中焦配合，促进食物的消化和吸收。与肾、膀胱在下焦协同，调节水液的代谢和排泄。而且，三焦还通过经络与其他脏腑相互联系，构成了一个有机的整体。在病理上，三焦的病变也会影响到其他脏腑的功能，反之，其他脏腑的疾病也可能波及三焦。
在中医临床中，三焦理论有着重要的应用价值。医生可以根据三焦的部位和功能特点，来判断疾病的部位和性质。例如，上焦病变多表现为发热、咳嗽等肺系症状；中焦病变常见食欲不振、腹胀等脾胃症状；下焦病变则可能出现小便不利、大便溏泄等症状。在治疗上，也会根据三焦的不同情况制定相应的治疗方案，如调理上焦宜宣肺清热，调理中焦需健脾和胃，调理下焦应利水通淋等。通过对三焦的辨证论治，能够更精准地治疗疾病，提高临床疗效。