女性生殖器官分为内生殖器官和外生殖器官两大部分。外生殖器官指生殖器官的外露部分，也被称为外阴，它涵盖了多个重要结构。阴阜是位于耻骨联合前面，皮下有丰富脂肪组织的部位，青春期开始生长阴毛。大阴唇为靠近两股内侧的一对隆起的皮肤皱襞，从阴阜向后延伸至会阴，富含血管、淋巴管和神经，受伤后易形成血肿。小阴唇是位于大阴唇内侧的一对薄皱襞，表面湿润、色褐、无毛，富含神经末梢，极为敏感。阴蒂位于两小阴唇顶端的联合处，是与男性阴茎海绵体相似的组织，具有勃起性，能感受性刺激并引起性兴奋。阴道前庭是两侧小阴唇之间的菱形区，内有尿道外口、阴道口等重要开口。
阴道是女性内生殖器官之一，是连接子宫与外阴的通道，也是排出月经血、娩出胎儿的管道。它是一个富有弹性的肌性管道，平时前后壁相互贴近，呈塌陷状态。阴道壁由黏膜、肌层和纤维组织膜构成，黏膜呈淡红色，有许多横行皱襞，具有较大的伸展性。阴道黏膜受性激素影响有周期性变化。阴道内环境呈酸性，这是因为阴道内有乳酸杆菌等有益菌，它们能将糖原分解为乳酸，维持阴道的酸性环境，抑制其他病原体生长，起到自净作用。然而，当阴道的自然防御功能遭到破坏时，病原体容易侵入，引发阴道炎症等疾病。
子宫是孕育胎儿和产生月经的器官，呈前后稍扁、倒置的梨形。子宫位于盆腔中央，膀胱与直肠之间，下端接阴道，两侧有输卵管和卵巢。子宫体壁由三层组织构成，外层为浆膜层（脏腹膜），中间为肌层，内层为子宫内膜。子宫内膜会随着卵巢激素的周期性变化而发生增生、分泌和脱落，形成月经。子宫肌层由平滑肌束及弹力纤维组成，具有很强的收缩性，在分娩时能产生有力的宫缩，帮助胎儿娩出。子宫借助阔韧带、圆韧带、主韧带和宫骶韧带等维持其正常位置。若这些韧带松弛或损伤，可能导致子宫脱垂等问题。
输卵管是一对细长而弯曲的肌性管道，位于阔韧带上缘内，内侧与子宫角相连通，外端游离，与卵巢接近。输卵管由内向外分为间质部、峡部、壶腹部和伞部。间质部是通入子宫壁内的部分，管腔最窄；峡部短而直，管腔较窄，是输卵管结扎的常用部位；壶腹部管腔宽大且弯曲，是精子和卵子结合受精的场所；伞部呈漏斗状，有许多指状突起，具有“拾卵”作用，能将卵巢排出的卵子捡拾到输卵管内。输卵管壁由三层构成，外层为浆膜层，中层为平滑肌层，内层为黏膜层。黏膜层有许多纤毛细胞，纤毛的摆动和肌层的蠕动有助于卵子或受精卵向子宫方向移动。
卵巢是女性的性腺，具有产生卵子和分泌性激素的功能。卵巢呈扁椭圆形，略呈灰红色，青春期前表面光滑，青春期开始排卵后，表面逐渐凹凸不平。卵巢位于盆腔内，靠卵巢系膜连接于阔韧带后叶的部位为卵巢门，血管、神经由此出入卵巢。卵巢实质分为皮质和髓质两部分，皮质在外层，含有不同发育阶段的卵泡、黄体和白体等；髓质在中央，无卵泡，含有疏松结缔组织及丰富的血管、神经、淋巴管等。卵巢分泌的雌激素、孕激素和少量雄激素等性激素，对女性的生殖系统发育、第二性征维持以及代谢等方面都起着至关重要的作用。例如，雌激素能促进女性生殖器官的发育和维持女性第二性征，孕激素则在怀孕过程中为胚胎着床和维持妊娠提供支持。